Das Helmholtz-Institut Mainz für Struktur, Symmetrie und Stabilität von Materie und Antimaterie (HIM) ist ein strategischer Partner des Exzellenzclusters PRISMA+. Es bietet zusätzliche Infrastruktur auf dem Campus der JGU und setzt seinen Hauptakzent auf neue Forschungsmöglichkeiten in der Hadronenphysik, insbesondere an der FAIR-Anlage der GSI Darmstadt.
Ein weiterer Partner auf nationaler Ebene ist das Helmholtz-Zentrum Berlin (HZB). Die Zusammenarbeit war entscheidend für den Test der MESA-Kryomodule in der Beschleunigeranlage bERLinPro.
Auf internationaler Ebene arbeitet PRISMA+ eng mit dem führenden nationalen Forschungslabor für Teilchenphysik in den USA, Fermilab (FNAL), zusammen.